瓜子宜保存在干燥通风阴凉处。如果是现炒的热瓜子，要等到放凉后放入罐子或袋子中密封保存，否则热瓜子立即包装更容易变潮。而已经开封的瓜子吃剩后更要密封好，可在包装袋再外面套一个自封袋密封，尽量赶走袋中空气，这样防潮效果更好。另外，没吃完的瓜子封好，还可放冰箱中冷冻保藏，不仅瓜子酥脆、不易变质产生哈喇味还能防虫鼠。
